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Xshell环境下利用VASP高效计算材料DOS教程
xshell下用vasp计算dos

首页 2024-12-05 19:12:10



在Xshell下使用VASP计算态密度(DOS) 在材料科学和凝聚态物理的研究中,计算材料的态密度(Density of States,简称DOS)是一项至关重要的任务

    态密度提供了关于材料电子结构的详细信息,对理解材料的电学、光学和磁学性质至关重要
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    Vienna Ab initio Simulation Package(VASP)作为一款强大的材料建模和仿真软件,广泛应用于这一领域

    本文将详细介绍如何在Xshell终端环境下,使用VASP计算材料的态密度

     一、准备工作 在开始计算之前,需要准备计算所需的文件和环境

    VASP计算通常涉及四个主要文件:INCAR、KPOINTS、POSCAR和POTCAR

    这些文件分别定义了计算参数、k点网格、晶胞结构和赝势

     1.INCAR文件:包含了VASP计算的各种参数设置,如精度(PREC)、能量截断(ENCUT)、自洽迭代收敛标准(EDIFF)、电荷密度读取方式(ISTART和ICHARG)、电子占据方式(ISMEAR和SIGMA)等

     2.KPOINTS文件:定义了k点网格的生成方式和密度

    对于DOS计算,通常需要更高的k点密度以获得更平滑的DOS曲线

     3.POSCAR文件:包含了晶胞的原子坐标和晶格参数

    这个文件通常从结构优化后的CONTCAR文件复制而来

     4.POTCAR文件:包含了计算所需的赝势信息,通常从VASP的赝势库中获取

     二、计算流程 VASP计算DOS的流程主要分为两步:静态自洽计算和非自洽计算

     1. 静态自洽计算 静态自洽计算的目的是获得自洽的电荷密度,这是后续非自洽计算的基础

     准备INCAR文件: 对于金属体系,可以设置ISMEAR=1和SIGMA=0.2;对于半导体和绝缘体,可以设置ISMEAR=0和SIGMA=0.05

    其他参数如PREC、EDIFF和ENCUT也需要根据具体情况进行设置

     bash SYSTEM=Al-fcc PREC=Accurate EDIFF=1e-5 ENCUT=250.0 ISTART=0 IBRION=2 ISMEAR=1 SIGMA=0.2 准备POSCAR文件: POSCAR文件包含了晶胞的原子坐标和晶格参数

    对于fcc结构的铝,可以如下设置: bash Al 3.975 0.0 0.5 0.5 0.5 0.0 0.5 0.5 0.5 0.0 1 Direct 0.0 0.0 0.0 准备KPOINTS文件: KPOINTS文件定义了k点网格的生成方式和密度

    对于DOS计算,需要更高的k点密度

    可以使用Monkhorst-Pack方法生成k点网格: bash Automatic generation 0 Monkhorst-Pack 9 9 9 0.0 0.0 0.0 提交运行: 将所有文件准备好后,可以通过Xshell提交计算任务

    计算完成后,需要记录OUTCAR文件中E-fermi的数值,这个值将在后续的非自洽计算中使用

     2. 非自洽计算 非自洽计算是在固定电荷密度的情况下,计算选取k点的能量本征值,从而获得态密度信息

     准备INCAR文件: 在非自洽计算中,需要设置ISTART=1和ICHARG=11,表示从CHGCAR中读入电荷分布并在计算中保持不变

    ISMEAR设置为-5,表示使用带Bloch修正的四面体方法计算DOS,这种方法可以获得更平滑的DOS曲线

     bash SYSTEM=Al-fcc PREC=Accurate ENCUT=250 ISTART=1 ICHARG=11 ISMEAR=-5 LORBIT=10 准备KPOINTS文件: 为了获得更高质量的DOS曲线,需要增加k点网格的密度

    可以使用与静态自洽计算相同的Monkhorst-Pack方法,但增加k点的数量: bash Automatic generation 0 Monkhorst-Pack 19 19 19 0.0 0.0 0.0 提交运行: 将所有文件准备好后,再次通过Xshell提交计算任务

    计算完成后,会得到包含态密度信息的DOSCAR文件

     三、后处理 计算完成后,需要对DOSCAR文件进行后处理,以获得总态密度和分波态密度

     使用read_dos.f90小程序: VASP提供了一个辅助小程序read_dos.f90,用于处理DOSCAR文件

    运行该程序时,需要输入E-fermi的值和POSCAR文件中的原子数

    程序会输出总态密度文件dos_total.dat和分波态密度文件_dos.dat

     bash ./read_dos.x DOSCAR 在运行过程中,程序会提示输入E-fermi的值和POSCAR中的原子数

    输入正确的值后,程序会生成所需的输出文件

     结果分析: 生成的dos_total.dat文件包含了总态密度的信息

    文件的第一列是能量值(单位为eV),第二列是总态密度的值(单位为State/eV·unit cell),第三列是总态密度的积分值(即电子数,单位为electrons)

    可以使用Origin等软件对结果进行绘图和分析

     生成的_dos.dat文件包含了分波态密度的信息

    文件的第一列是能量值(单位为eV),第二、三、四列分别对应于s、p、d态的分波态密度值(单位为State/eV·atom)

    可以对这些数据进行进一步的分析和比较

     四、总结 本文详细介绍了在Xshell下使用VASP计算材料态密度的流程和要点

    通过静态自洽计算和非自洽计算两步,可以获得包含态密度信息的DOSCAR文件

    通过read_dos.f90小程序的后处理,可以得到总态密度和分波态密度的数据,并进行绘图和分析

    这一方法不仅适用于金属体系,也适用于半导体和绝缘体体系,为材料科学和凝聚态物理的研究提供了有力的工具

     在进行DOS计算时,需要注意选择合适的k点密度和ISMEAR参数以获得高质量的DOS曲线

    同时,也需要对计算结果进行仔细的分析和验证,以确保结果的准确性和可靠性

    希望本文能为广大科研工作者提供有益的参考和帮助